Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD4O60885 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD4O60885 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD4O60885 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BRD4O60885 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD4O60885 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD4O60885 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD4O60885 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD4O60885 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD4O60885 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD4O60885 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD4O60885 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD4O60885 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD4O60885 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD4O60885 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRD4O60885 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRD4O60885 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRD4O60885 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRD4O60885 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BRD4O60885 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD4O60885 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD4O60885 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD4O60885 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD4O60885 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRD4O60885 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD4O60885 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms