Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms