Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHMP2AO43633 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms