Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA3O43365 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms