Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms