Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASKO14936 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASKO14936 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASKO14936 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASKO14936 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASKO14936 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASKO14936 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASKO14936 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASKO14936 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASKO14936 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASKO14936 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASKO14936 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASKO14936 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms