Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APAF1O14727 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APAF1O14727 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APAF1O14727 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APAF1O14727 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APAF1O14727 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APAF1O14727 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APAF1O14727 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APAF1O14727 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APAF1O14727 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APAF1O14727 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APAF1O14727 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
APAF1O14727 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APAF1O14727 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APAF1O14727 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APAF1O14727 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APAF1O14727 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APAF1O14727 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APAF1O14727 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APAF1O14727 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APAF1O14727 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APAF1O14727 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APAF1O14727 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APAF1O14727 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
APAF1O14727 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APAF1O14727 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APAF1O14727 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APAF1O14727 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APAF1O14727 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APAF1O14727 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APAF1O14727 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APAF1O14727 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APAF1O14727 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
APAF1O14727 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms