Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP23O00161 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms