Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB9F8W1W9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB9F8W1W9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms