Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms