Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms