Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP15Q9Y4E8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP15Q9Y4E8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms