Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9Y3F1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9Y3F1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms