Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF5Q9Y2D1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF5Q9Y2D1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF5Q9Y2D1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF5Q9Y2D1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF5Q9Y2D1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF5Q9Y2D1 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF5Q9Y2D1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF5Q9Y2D1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF5Q9Y2D1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF5Q9Y2D1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms