Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1AQ9Y241 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms