Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOD1Q9Y239 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOD1Q9Y239 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms