Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AGTPBP1Q9UPW5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms