Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF346Q9UL40 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF346Q9UL40 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms