Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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GTF3C4Q9UKN8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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GTF3C4Q9UKN8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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GTF3C4Q9UKN8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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GTF3C4Q9UKN8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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GTF3C4Q9UKN8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C4Q9UKN8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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