Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms