Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HACL1Q9UJ83 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HACL1Q9UJ83 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HACL1Q9UJ83 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms