Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP2Q9UHC6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms