Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNRD1Q9P1U0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms