Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TVP23BQ9NYZ1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TVP23BQ9NYZ1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms