Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLCO1C1Q9NYB5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1C1Q9NYB5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms