Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDAP2Q9NXN4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDAP2Q9NXN4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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