Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER2Q9NSB8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms