Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 BAHCC1-204ENST00000583828 591 ntTSL 329.58■■■□□ 2.336e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 MED22-207ENST00000494177 532 ntTSL 429.51■■■□□ 2.316e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ADAM8-203ENST00000463298 1122 ntTSL 529.15■■■□□ 2.266e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.216e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.166e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.146e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.16e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.046e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 UBAP2L-211ENST00000456325 812 ntTSL 327.35■■□□□ 1.971e-6■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 KLC2-212ENST00000526758 594 ntTSL 427.35■■□□□ 1.976e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN14-208ENST00000469149 959 ntTSL 227.34■■□□□ 1.976e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.926e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 MED22-206ENST00000482295 491 ntTSL 326.74■■□□□ 1.876e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ADAM8-209ENST00000559180 560 ntTSL 326.69■■□□□ 1.866e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 UBAP2L-210ENST00000441890 678 ntTSL 226.55■■□□□ 1.841e-6■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.836e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ZBTB7B-205ENST00000483226 243 ntTSL 326.45■■□□□ 1.826e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.88e-10■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.786e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.761e-12■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 SMC6-206ENST00000446852 2460 ntTSL 1 (best)25.98■■□□□ 1.756e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ADAM8-210ENST00000560135 818 ntTSL 1 (best)25.84■■□□□ 1.736e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 CIC-208ENST00000575839 335 ntTSL 525.31■■□□□ 1.646e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 MED22-204ENST00000457204 561 ntTSL 425.26■■□□□ 1.636e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.596e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 KLC2-209ENST00000461611 643 ntTSL 324.94■■□□□ 1.586e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.566e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.526e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 KLC2-213ENST00000531240 559 ntTSL 424.19■■□□□ 1.466e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ADAM8-206ENST00000486609 776 ntTSL 524.19■■□□□ 1.466e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 P3H3-208ENST00000544813 573 ntTSL 523.91■■□□□ 1.428e-10■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 KLC2-208ENST00000440228 620 ntTSL 423.84■■□□□ 1.416e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 LAMTOR4-204ENST00000466498 371 ntTSL 223.59■■□□□ 1.376e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 FBXL19-203ENST00000427128 3312 ntTSL 1 (best)23.58■■□□□ 1.366e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.263e-9■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 BCORL1-204ENST00000488135 857 ntTSL 322.55■■□□□ 1.26e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.28e-10■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.198e-10■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.186e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.166e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 BCORL1-206ENST00000607874 468 ntTSL 322.25■■□□□ 1.156e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 LONRF1-207ENST00000530693 508 ntTSL 422.2■■□□□ 1.146e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 UBAP2L-204ENST00000368504 1120 ntTSL 522.19■■□□□ 1.141e-6■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ALAS2-205ENST00000463868 646 ntTSL 321.14■□□□□ 0.988e-10■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ALAS2-207ENST00000493869 658 ntTSL 221.14■□□□□ 0.988e-10■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 CORO1C-205ENST00000546571 899 ntTSL 421.09■□□□□ 0.976e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.936e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.936e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.96e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.816e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.796e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.746e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 TACC3-210ENST00000485989 726 ntTSL 319.57■□□□□ 0.726e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ACER3-201ENST00000278544 3500 ntTSL 1 (best)19.54■□□□□ 0.726e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 NIPSNAP1-205ENST00000494966 441 ntTSL 319.28■□□□□ 0.681e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.676e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.66e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.586e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.586e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 NIPSNAP1-203ENST00000437094 674 ntTSL 318.68■□□□□ 0.581e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.526e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 P3H3-202ENST00000536140 3226 ntTSL 218.3■□□□□ 0.528e-10■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.526e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 TACC3-209ENST00000484651 2715 ntTSL 218.23■□□□□ 0.516e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ALAS2-206ENST00000477869 582 ntTSL 518.18■□□□□ 0.58e-10■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ABHD17B-201ENST00000333421 2614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.478e-10■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.466e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ACER3-210ENST00000531352 2093 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.456e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.436e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.356e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.316e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.296e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 NIPSNAP1-204ENST00000455496 600 ntTSL 316.14■□□□□ 0.171e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 TACC3-206ENST00000470136 650 ntTSL 316.01■□□□□ 0.156e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 CORO1C-212ENST00000549772 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.136e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.16e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.031e-6■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.031e-6■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.16e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 PDCD6-208ENST00000511482 878 ntTSL 513.83□□□□□ -0.196e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 CORO1C-208ENST00000547294 566 ntTSL 513.6□□□□□ -0.236e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 SMC6-204ENST00000428868 544 ntTSL 413.51□□□□□ -0.256e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 LAMTOR4-212ENST00000494136 427 ntTSL 212.94□□□□□ -0.346e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.346e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN14-206ENST00000372164 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.366e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 CORO1C-207ENST00000547170 804 ntTSL 412.72□□□□□ -0.376e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.381e-6■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.431e-6■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 SMC6-207ENST00000448223 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.546e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 CORO1C-213ENST00000550032 547 ntTSL 211.65□□□□□ -0.556e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 SUCO-205ENST00000608566 756 ntTSL 211.5□□□□□ -0.576e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.636e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.676e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.736e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ILF2-203ENST00000368684 476 ntTSL 510.18□□□□□ -0.786e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ALAS2-204ENST00000455688 664 ntTSL 29.76□□□□□ -0.858e-10■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 ACER3-208ENST00000530334 931 ntTSL 29.48□□□□□ -0.896e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.176e-7■■■□□ 19.2
DROSHAQ9NRR4 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.446e-7■■■□□ 19.2
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