Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DUOX2Q9NRD8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms