Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAT1LQ9HCJ6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms