Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC4Q9H6D8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms