Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF1DQ9H5J8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1DQ9H5J8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms