Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12CQ9C0D7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZC3H12CQ9C0D7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12CQ9C0D7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12CQ9C0D7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12CQ9C0D7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12CQ9C0D7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12CQ9C0D7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12CQ9C0D7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms