Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4AQ9BY43 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms