Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS2Q9BXC9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS2Q9BXC9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS2Q9BXC9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS2Q9BXC9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS2Q9BXC9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS2Q9BXC9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS2Q9BXC9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS2Q9BXC9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS2Q9BXC9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS2Q9BXC9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS2Q9BXC9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS2Q9BXC9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS2Q9BXC9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms