Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NDC1Q9BTX1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDC1Q9BTX1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms