Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM2D3Q9BRN9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TM2D3Q9BRN9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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