Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIN3AQ96ST3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms