Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms