Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf49Q96NF6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms