Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1Q96NA8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms