Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSMCE3Q96MG7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE3Q96MG7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms