Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms