Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms