Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTV1Q96GA3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTV1Q96GA3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTV1Q96GA3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTV1Q96GA3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTV1Q96GA3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTV1Q96GA3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTV1Q96GA3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTV1Q96GA3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTV1Q96GA3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTV1Q96GA3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms