Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms