Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCC1Q96CN9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms