Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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GTF3C6Q969F1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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GTF3C6Q969F1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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GTF3C6Q969F1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6Q969F1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
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