Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF4Q8WXU2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF4Q8WXU2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms