Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF31Q8WWY3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms